Theo Quyết định 509/QĐ-UBND của UBND TPHCM, tính đến ngày 1/1/2021, 43/43 trung tâm y tế và bệnh viện quận/huyện trực thuộc UBND quận/huyện đã được tổ chức lại thành trung tâm y tế và bệnh viện quận - huyện trực thuộc Sở Y tế với 12.863 người làm việc.
PGS.TS.BS Tăng Chí Thượng, Giám đốc Sở Y tế TPHCM đề xuất đổi mới cơ cấu tổ chức trạm y tế, không phân bổ trạm y tế theo hệ thống hành chính (mỗi phường, xã, thị trấn có 1 trạm y tế) mà theo khu vực và quy mô dân số, kiến nghị cứ mỗi khu vực có 10.000 dân có một trạm y tế.
Phân bổ định biên, loại hình nhân viên y tế của trạm y tế đảm bảo phù hợp với chức năng và nhiệm vụ của trạm. Bên cạnh bác sĩ, điều dưỡng, hộ sinh, dược sĩ, trạm y tế cũng cần quan tâm đến loại hình nhân viên y tế công cộng.
TPHCM hy vọng được thí điểm tổ chức thực hành lấy chứng chỉ hành nghề cho bác sĩ mới tốt nghiệp với 12 tháng thực hành tại y tế cơ sở (tại Trung tâm y tế và Trạm y tế) và 6 tháng thực hành tại các bệnh viện (thay vì thực hành 18 tháng tại các bệnh viện theo quy định).
Trạm y tế phường, xã, thị trấn có thể được hợp tác với y tế tư nhân cung ứng các dịch vụ khám bệnh, chữa bệnh cho người dân trên địa bàn (phòng khám nha khoa, phòng khám y học cổ truyền,…).