Theo phản ánh từ một số doanh nghiệp thuộc Hiệp hội Doanh nghiệp dịch vụ Logistics Việt Nam (VLA), từ tháng 11, một số hãng tàu đã thông báo thu phụ phí nhiên liệu (Low Sulphur Surcharge - LSS). Thông thường, phụ phí LSS được áp dụng tại cảng bốc hàng, tuy nhiên các chủ hàng gửi hàng từ Việt Nam đi nước ngoài đã và đang đóng các phí này cho các hãng tàu. Thậm chí, có một số hãng tàu tuyến Trung Quốc về Việt Nam thu cả phụ phí LSS tại cảng đích (nơi nhận hàng).
Không chỉ đóng phụ phí LSS tại cảng bốc hàng và cảng nhận hàng, các chủ gom hàng tại Việt Nam lại thu phí LSS từ nhà nhập khẩu Việt Nam để hoàn trả lại cho đại lý tại Trung Quốc.
Một số doanh nghiệp cho rằng, việc thu phí LSS tại cảng đích như vậy là sai nguyên tắc vì LSS là phụ phí phát sinh ở cảng đi và phải được trả bởi các chủ hàng chứ không phải nhà nhập khẩu. Điều này đã làm tăng chi phí và gánh nặng cho nhà nhập khẩu của Việt Nam.
Việc thu phí LSS tại Việt Nam để trả lại cho đại lý bằng hình thức phát hành hóa đơn giá trị gia tăng (VAT) 10%, như vậy phụ phí này đang được xem như phí tại địa phương (local charge) nên đã làm phát sinh doanh thu đối với doanh nghiệp phát hành hóa đơn, dẫn đến phát sinh thuế.
Phía VLA cho rằng phụ phí này là một phần của tiền cước, ai trả cước thì người đó phải trả phụ phí này, bất kể là cước trả trước hay trả sau. Ông Lê Duy Hiệp, Chủ tịch VLA cho biết, hiện tại các hãng tàu vẫn tiếp tục thu phụ phí LSS. VLA cùng các doanh nghiệp đang đấu tranh để các hãng tàu không lạm thu phụ phí LSS. Đồng thời, doanh nghiệp cần tư vấn cho khách hàng khi ký hợp đồng mua bán hàng hóa thì quy định phụ phí này do ai trả để ghi rõ lên vận đơn, tạo cơ sở pháp lý để xác định ai phải trả phụ phí LSS.
Hiện tại, các hãng tàu đã thông báo đến các doanh nghiệp xuất nhập khẩu về việc sẽ thu thêm phụ phí nhiên liệu từ đầu năm 2020. Mức thu dao động từ 35 - 80 USD/container 20 feet và từ 70 - 160 USD/container 40 feet tuỳ theo khu vực.