Quá trình điều tra sẽ kéo dài trong 12 tháng (kể từ ngày khởi xướng) và có thể gia hạn, nhưng không quá 18 tháng. Các đơn vị bị KTC lựa chọn để tiến hành gửi câu hỏi điều tra, thu nhập thông tin có 37 ngày để trả lời. Các doanh nghiệp khác không bị chọn có thể gửi yêu cầu (bằng văn bản) đề nghị được tham gia làm bị đơn tự nguyện và tính toán mức thuế riêng cho từng doanh nghiệp.
Trong quá trình điều tra, KTC sẽ tổ chức phiên điều trần để các bên liên quan trong vụ việc có thể tham gia, trình bày quan điểm về các nội dung điều tra.